近年来我国化肥关税政策变化较大，大体经历了出口退增值税取消出口退税加征出口关税加征特别出口关税2008年国际金融危机后出口政策逐步放松2014年旺季关税大幅下调的过程。总的来看，我国化肥关税政策综合考虑了国内化肥市场供给、化肥优惠政策、能源价格、国际市场价格、企业经营状况等多种因素，呈现以下四方面特点。
　　把保障国内供给放在**位。我国对化肥行业的定位非常明确，不是把它定位于出口型行业，而主要是保障国内供给，为农业生产服务。只有在保障了国内供给，同时又不会对国内市场产生大影响的条件下，化肥才可适量出口。2004年以前，我国对化肥出口采取鼓励政策，那时出口还能享受退增值税的优惠，但2004年以后相当长一段时间，我国一直是采取高关税限制出口。强力关税政策的出台，对抑制化肥大量出口，稳定国内市场化肥供应量，保障农民能买得到化肥，起到了重要作用。
　　堵疏结合，实行淡旺季不同关税。2007年，我国化肥出口开征季节性关税，不同季节执行不同税率。2008年11月14日出台的关税方案中，明确提出了淡旺季概念，这是我国化肥关税史上的一次重大变化。国内用肥旺季时，用高关税限制出口，保障国内供给；淡季时，可降低关税允许出口。这既考虑了农民利益，也考虑了企业利益，同时考虑了近年来我国化肥产量大幅增加、国内供给能力增加的现状，是一种堵疏结合、调节自如的好形式。
　　相对稳定性，一年一定。2008年一年之内，化肥关税政策出现了四次大调整，令企业无所适从。2009年以后，政策强调相对稳定性，取消了暂定，基本上是一年一定，在前一年的11月、12月份，出台第二年的化肥关税政策，让企业心中有数、便于操作。
　　与国内外市场基本相适应。近些年化肥关税的一个典型特点，就是与时俱进，与国内外市场特点基本相适应。当国际市场需求量大幅增加，引发国内化肥大量出口时，采用高关税政策，以抑制出口，减少国际市场对国内市场的冲击。当国际市场景气度不高，需求平淡时，出口政策相对较为宽松。例如，2008年下半年国际金融危机后，化肥出口政策明显宽松了许多。